截至2018年底，庆元县共有医疗卫生机构131个，其中：医院、卫生院20个，妇幼保健院（所、站） 1个，疾病预防控制中心（防疫站）1个，卫生监督所（中心）1个。卫生技术人员1119人，其中执业医师和执业助理医师447人，注册护士385人。
